96年度下半年大學系所評鑑結果出爐，評鑑結果吊車尾的立德管理學院表示「接受結果、持續改善」。文化大學校長表示，部分系所將提申訴，有問題的會改善。海洋大學商船系則說，對結果並不服氣，將提出申訴。

立德管理學院代理校長徐德修表示，立德成立才7年，許多教師到校任教5到6年，根本沒有機會升等，「新設大學評鑑時很吃虧」。立德已計畫進行系所合併改名，97學年度要把營建科技系改名為營建與物業管理學系，並已確定今年8月更名為「立德大學」。

文化大學的美國研究所碩士班與政治研究所博士班評鑑未通過，李天任說，「此次文化社會科學院表現得特別不理想」，三月看過訪評意見，側面得知部分系所初評通過，但結果卻與預期大不相同。他肯定大學評鑑用心，但制定公開、透明的評鑑與申訴機制更重要。

輔仁大學學術副校長林思伶，形容被評待觀察的哲學系、基礎醫學研究所、護理學系與生命科學系四系所師生心情是「錯愕與不平」，哲學系與生命科學系確定將提申訴。輔大哲學系主任潘小慧說，輔大六任校長裡有四位都是哲學家，包括校長黎建球。「如果連輔大哲學系都沒過，那他校的哲學系皮就得蹦緊了。」

海大表示，委員在報告中給高度肯定，最後卻給「待觀察」，令人無法理解。